生物多樣性公約提出2050願景，希望在2050年以前，生物多樣性能夠被人類重視、保育及復育，明智使用，維持生態系服務，維續健康的地球，並且提供人類重要的好處。流域的概念為從水連結到陸地，象徵土地上養分提供與循環的血脈，提供一個實現2050願景的角度。

        有鑑於此，國立臺南大學於107年11月設立「流域生態環境保育研究中心」，期望能貢獻於生態環境保育，敦促開發與工程兼顧生態保育，並突顯生物多樣性與生態系服務帶給人類社會的貢獻，以維護國內生態環境之健康。

        本中心之成立目的為研究流域水域環境生態學及復育流域生態環境，協助韌性流域生態環境經營管理，以達成生態環境保育的目標。

        本中心之願景為促進人類活動與自然生態環境的和諧共處，突顯自然生態環境帶給人類的好處與價值，敦促開發與工程兼顧生態保育，並且協助規劃生態復育。

        流域生態環境保育研究中心由富有溪流生態和生態調查經驗的國立臺南大學生態暨環境資源學系王一匡老師為中心主任，遴選陸域與水域生態資源調查等專業領域之優秀人員負責研擬研究計畫及執行計畫。由王一匡主任負責統籌所有計畫之工作指揮與任務分配，並負責進度與工作品質之掌握。每一個計劃由一位專案經理擔任計畫主要聯絡窗口，實際掌控與安排各項工作之規劃、執行與管理，並協助組員之溝通協調與作業人力。